#L0419. 基因序列相似度
基因序列相似度
题目背景
在生物信息学中,基因可以看作由四种核苷酸组成的序列,简记为 A, C, G, T。研究人员经常需要衡量两条基因序列之间的相似程度,这对于疾病诊断和药物研发有着重要意义。
题目描述
两条基因序列的相似度计算方法如下:
将两条序列的碱基逐位对应,中间可以插入空位 -。例如,序列 AGTGATG 和 GTTAG 可以对齐为:
每对碱基之间的相似度由下表给出:
$$\def\arraystretch{1.5} \begin{array}{ |c|c|c|c|c|c|} \hline & \tt A & \tt C & \tt G & \tt T & \texttt - \\ \hline \tt A & 5 & -1 & -2 & -1 & -3\\ \hline \tt C & -1 & 5 & -3 & -2 & -4 \\\hline \tt G & -2 & -3 & 5 & -2 & -2 \\\hline \tt T & -1 & -2 & -2 & 5 & -1 \\\hline \texttt - & -3 & -4 & -2 & -1 & * \\\hline \end{array}$$上述对齐的相似度为:。
由于对齐方式不唯一,相似度定义为所有对齐方式中相似度的最大值。例如另一种对齐:
$$\def\arraystretch{1.5} \begin{array}{|c|c|c|c|c|c|c|} \hline \tt A & \tt G & \tt T & \tt G & \tt A & \tt T & \tt G \\ \hline \texttt - & \tt G & \tt T & \texttt T & \texttt A & \texttt - & \tt G \\ \hline \end{array}$$相似度为:。
输入格式
共两行。每行首先是一个整数 ,表示基因序列的长度;隔一个空格后是一个基因序列,序列中只含 四种字母。。
输出格式
仅一行,即两条基因序列的最大相似度。
样例
7 AGTGATG
5 GTTAG14
提示
答案不唯一,评测使用 Special Judge 校验输出是否合法。
难度
普及
通过率
—
尝试
0
已通过
0
- ID
- 1147
- 类型
- 传统题
- Time Limit
- 1000ms
- Memory Limit
- 125MiB
- 上传者